在过滤深度处理工艺中最常用的是膜分离法。该工艺利用隔膜使溶剂(通常是水)同溶质或微粒分离。根据通过膜的物质不同，又可以将其分为渗析和渗透，若通过膜的是溶质则称为渗析，若通过的是溶剂则称为渗透。而根据溶质或溶剂透过膜的推动力不同，又可以分为电渗析或电渗透，扩散渗析或自然渗透以及应用最多的反渗透、超滤和微孔过滤
制药过程中产生的有机废水是主要污染源,尽管制药工业产值仅占全国工业总产值的1.7%,但其污水排放量占全国污水排放量的2%。制药工业废水主要有抗生素类废水、中药废水和化学制药废水。
将废水引入调节池,调节废水pH为7.0-7.5。废水经污水泵送至水解池,使废水产生水解反应去除部分较容易降解的有机污染物,还可以将较难降解的大分子有机物分解为较简单的小分子有机物。
通常来说制药废水中含有的污染物质组分复杂，含量高，并且包含有生物抑制物、有毒害物质、难W被微生物降解等。其污染特性具有颜色和气味，悬浮物含量大，且易泡沫化等。
影响反渗透技术的渗透效果因素有很多，主要集中在压力、温度、盐的浓密和渗透膜污染等因素。在渗透过程过程中，反渗透技术对水温比较敏感，水温的变化会影响水产量，水温和水产量呈正比关系，温度升高，水产量也增加，这也是造成渗透膜水分子的粘度下降的主要因素。
反渗透膜的化学清洗是反渗透装置运行维护中的一个重要环节，它直接影响着反渗透膜的使用性能和使用寿命在系统的运行中，尽管选择了适宜的操作条件，但随着运行时间的增加，膜组内的微生物、有机物和无机杂质颗粒会不可避免的污堵膜表面，使反渗透膜发生污堵，造成系统产水量下降及脱盐率下降等情况。
生物法是靠微生物酶来氧化或还原染料分子，破坏其不饱和键及发色基团，从而达到处理目的的一种废水处理方法。由于微生物繁殖速率快、适应性强、成本低廉，近年来在煮练废水的处理中得到了广泛的应用。根据生物处理的反应机制，生物法可分为好氧生物法和厌氧生物法。
煮练废水中主要的污染物质为残余染料、助剂、浆料及其他化学物质。其中染料多数呈胶体状态，采用化学混凝法能够有效地去除废水中的残余染料，很大程度上降低废水的COD。所谓化学}昆凝法是指通过向废水中投加絮凝剂，利用絮凝剂的吸附架桥，压缩双电层及网捕作用，使水中胶体及悬浮物失稳、相互碰撞和凝聚转而形成絮凝体，再用沉淀或气浮工艺使颗粒从水中分离出来以达到净化水体的方法。
据统计，“十五”期间，江、浙、粤3省印染生产量占全国的76%，纺织印染业集群区域占该地区全部工业的50%以上。与国外单位数量印染产品相比较，我国印染耗水量高约2倍，排污总量是国外产品的1.2～1.8倍。其原因主要是国内纺织印染生产工艺中，很多物质没有得到充分利用，而随废水一同排放，其中以棉纺织产品生产所带来煮练废水最为典型。
含重金属离子的废水，都可采用中和沉淀法。首先调节废水的pH值，使重金属离子形成氢氧化物沉淀，加适量的水神牌絮凝剂，均可有效地去除重金属离子。试验和应用实践都证明，铁系絮凝剂具有沉降速度快、沉渣含水率低、易脱水等特点。
